军团杆菌自然存在于地表水中，经过水处理工艺之后仍可能存活，从而潜入市政供水系统。此外还会因主水管故障或在施工期间渗透到我们的供水系统中，从而影响水系统安全。进入工厂之后，军团杆菌会污染冷却水和饮用水系统，最终蔓延到水龙头、淋浴、热水浴缸​​和漩涡水疗中心。这些系统在使用时会产生被污染的水滴或雾气，导致细菌被吸入肺部，造成易感人群患上军团病。